Hola a todos!

Mi nombre es María y soy estudiante de doctorado en la Universidad de Amsterdam.

Decidí empezar este blog hace 5 años con el fin de explicar conceptos científicos para todo el mundo mediante experimentos que se pueden hacer fácilmente en casa!

Voy a escribir principalmente sobre biología y química y espero que mis experimentos os van a motivar para probarlos en casa, y para aprender más.

Espero que os guste.

Maria

¡Recuerda la ciencia no es sólo para científicos!

No sólo puedes llevar a cabos tus propios experimentos, en el puro estilo del “biohackeo”, pero ahora mismo hay mucho proyectos de “Ciencia ciudadana” en los que todos podemos participar.
Aquí os dejo unos ejemplos:

1) Saca la lengua
Proyecto catalán en el cual podemos averiguar qué bichos viven en nuestras bocas. Tienes la maravillosa oportunidad de ayudarles a analizar sus datos a la vez que aprendes más sobre tu cuerpo.

2) Fossil finder
Ayuda a los científicos a identificar fósiles u objetos arqueológicos en el Kenia. Allí han encontrado los utensilios hechos de piedra más viejos en el mundo que se remontan a más 3.3 millos de años atrás. Sólo tienes que mirar diferentes fotos que los científicos han tomado y señalizar si ves algún posible fósil. Como muchos otros también van a mirar las fotos, podemos ayudar a los científicos a ahorrar tiempo y a excavar en estas “zonas calientes”.

3) Galaxy zoo
En el universo hay una gran cantidad de galaxias de distintas formas, tamaños y colores. Ayuda a clasificarlas y a ponerlas su sitio correspondiente en el “zoo” para poder cartografiar el universo

Para ver más proyectos haz clic aquí.

¡Escoge el que más te guste, ya no tienes excusas para no hacer ciencia!
¡Cuéntanos sobre tu experiencia en el blog!

How to check for peroxidase activity in plants

Peroxidases are an enzymatic group capable of eliminating the hydrogen peroxide. This compound, which is toxic for the majority of the organism, it is being decomposed in water (H2O) and oxigen (O2) by the catalytic activity of the peroxidases (See below).

2H2O2 + peroxidase –> 2H2O+ O2

Some of the surrounding plants have symbiosis with nitrifying bacteria which contains high concentration levels of peroxidase. An example ofm the plants that experiment this type of symbiosis are the ones belonging to the Fabacea or Leguminosae Family like clovers,lentils, peas etc.

Image

On this image you can see the monomer structure of the horse-radish peroxidase.It was obtained from PDB database, accession number 4A5G

How to do it?

If we take the root of the plants described previously (where I live these are the clovers),we can observe small nodules, in which the bacteria are expected to accumulate. If we make an transversal cut on this root part and apply some oxygen peroxide (such as the one used for wounds), we are able to see tiny bubbles. These bubbles correspond to the oxygen released during the decomposition process of the hydrogen peroxide and they indicate the presence of peroxidase in the roots.

This way we have an easy way to test if the plant possesses peroxidase activity or not! If somebody could try it directly on horseradish it would be great.

Como comprobar la actividad peroxidasa en plantas?

Las peroxidasas son un grupo de enzimas encargadas de eliminar el peróxido de hidrogeno (H2O2). Este compuesto que es tóxico para la mayoría de los organismos, se ve descompuesto en moléculas de peróxido de hidrogeno en agua (H2O) y oxigeno (O2) bajo la actividad de las peroxidasas (Ver la reacción a continuación).

2H2O2 + peroxidasa  —> 2H2O+ O2

Muchas de las plantas que nos rodean presentan una simbiosis con bacterias fijadores de nitrógeno que poseen este enzima en altas concentraciones.  Un grupo muy conocido de plantas que han desarrollado esta simbiosis son las Fabaceas o leguminosas como pueden ser los tréboles, habas, y soja. la imagén de abajo representa la estructura de monomero de la peroxidasa del rábano. 

Image

Estructura de un monómero de la peroxidasa del rábano. (A partir de la base de datos PDB, número de ascessión 4A5G).

Si cogemos las raíces de estas plantas (los más fáciles de encontrar por lo menos donde vivo yo son los tréboles), podemos observar unos pequeños nódulos, que corresponden a la acumulación de las bacterias. Al hacer un corte transversal en esta zona y aplicar una gotitas de agua oxigenada (que es peróxido de hidrogeno), podremos ver unas pequeñas burbujas. Estas burbujas corresponden al oxigeno liberado durante el proceso de descomposición del peróxido de hidrogeno., y nos indican la presencia de peroxidasa en las raíces. 

¡De esta forma tenemos un método fácil de saber si la planta posee actividad peroxidasa o no! ¡Si alguien lo puede probar con el rábano sería maravilloso!

Electroforesis casera

 Una vez que podemos cultivar nuestras propias bacterias, purificar el ADN un paso muy importante sería ser capaz de cortarlo en pequeños trocitos y conseguir hacer una electroforesis. Bien aun no sé como cortarlo de forma específica (en Biotecnología se utilizan enzimas de restricción, pero son bastantes caras y difíciles de purificar ), pero si he podido encontrar un sitio donde explica cómo realizar una electroforesis de manera fácil y barata en tu propia casa.

Materiales

2 platos hondos (de esos de comer la sopa), 1 cucharilla, sal de mesa (NaCl), bicarbonato sódico (NaHCO3, se utiliza en la cocina), papel de filtro, 2 portaobjetos, cableado eléctrico, 5 pilas de petaca (de las de 9V), 1 lápiz.

Procedimiento:

Primero llenamos cada plato con 300mL de agua aproximadamente. Le añadimos una cucharilla de NaCl , y una cucharilla de NaHCO3. Colocamos los platos en paralelo como podemos ver en el dibujo. Entre los platos situamos un portaobjeto que nos hará de apoyo. Por otra parte recortamos una tira de papel de filtro (vale el del café), y lo empapamos del medio electroforético. Situamos esta tira encima del portaobjetos y dejamos que cada extremo de la tira esté en contacto con el electrolito de cada plato. Posteriormente dibujamos una línea transversal a lápiz en la tira. Por otra parte realizamos el circuito eléctrico, colocamos las 5 pilas en serie, y de cada polo de las pilas de los extremos sacamos un cable que sumergiremos en cada plato.

Ahora probamos si el montaje funciona, (figura siguiente), para ello nos sacamos una gotilla de sangre y la posamos sobre la línea dibujada en la tira de papel, colocamos un portaobjetos encima del papel y conectamos el circuito eléctrico. Con el paso del tiempo, si el montaje funciona, se deberían observar 5 manchas a lo largo de la tira en dirección al polo negativo. En todo caso, tened la precaución de no suministrarle más voltaje al montaje, de no tocar ni el electrolito ni la tira, y de desconectar el circuito cuando termine la migración, además de cargar la tira con el circuito.

Información obtenida en:

http://biovigo.blogspot.com/2008/11/electroforesis-casera.html

Nosotros si queremos hacer una electroforesis para separar DNA en lugar del utilizar el portaobjetos deberíamos hacer un gel de agarosa en el cual colocamos las distintas muestras de DNA.  Además tendríamos que añadir un marcaje en cada muestra de DNA para poder ver la migración del DNA y mirarlo bajo luz fluorescente.

Extracción casera de DNA

Como bien sabréis el ADN ( ácido desoxirribonucleico) es un macromolécula que contiene la información genética utilizada para el correcto desarrollo y funcionamiento del organismo.

Para extraerlo solamente son necesarios los siguientes objetos: un vaso transparente preferiblemente ya que de esta forma es más fácil observarlo, sal, lavavajillas, zumo de pomelo, alcohol.

En un vaso, se deposita una muestra de saliva (simplemente hay que escupir en el vaso).  Una vez obtenida, se añade la sal, le lavavajillas ( ej. Fairy), zumo de pomelo y alcohol y se mezclan. Nota si no tenéis alcohol que se utiliza normalmente para las heridas ( que suele estar muy concentrado, alrededor de un 96%, también vale alcohol que se utiliza normalmente para beber si es suficientemente “fuerte” como puede ser el ron, vodka, absenta lo que tengáis a mano). Personalmente lo intente con una disolución anti acné para la cara pero no estaba suficientemente concentrado.

El lavavajillas es el encargado de romper las membranas celulares de tal forma que todo el contenido celular se libera en el medio, incluido el DNA.  La sal es la encargada de amalgamar las moléculas de DNA, mientras que el zumo de pomelo neutraliza las proteínas que podrían perjudicarlo. Por último el DNA es separado por el alcohol, y se puede ver una sustancia mucosa transparente que es el DNA. Este se puede sacar del tubo simplemente con un mondadientes.

¡Esto es todo! Fácil y sencillo sin tener que utilizar una batidora como aparece en algunos enlaces de internet.

Welcome to DIY science!

 

Bienvenidos a DO IT YOURSELF SCIENCE!

Este proyecto trata acerca de una iniciativa originada en EEUU, y que consiste en el desarrollo de tus propias ideas en casa. Puede ser desde cultivar tu propia cepa mutada en el bote de yogur en la nevera al lado de tu comida, hasta tratar de hacer tu propio robot casero.

 

Welcome to DO IT YOURSELF SCIENCE!

This project tries to bring closer an initiative originated in USA, and which consists on developing your own ideas just at home.  It could be from growing your own mutated bacteria on the yoghurt on your fridge next to your food, to  trying to make your own hand made robot.